- Анализ генотипа (генотипирование) является важным инструментом для выявления мутаций в основной части генома SARS-CoV-2, - говорит заместитель директора Центра передовых технологий Алишер Абдуллаев. - Известно, что коронавирус имеет гены, кодирующие его собственные структурные белки. Эти структурные белки являются потенциальными мишенями для будущих вакцин. Поэтому очень важно до начала разработки вакцины выявлять любые изменения в нуклеотидных последовательностях генов вирусной РНК, приводящие к изменению структурных белков. Кроме того, данные генотипирования могут быть использованы для прогнозирования эффективности глобальной вакцины в некоторых странах, где чаще встречается тот или иной штамм с определенным типом важных мутаций. Поэтому мы решили проанализировать эти структурные гены. Предварительный анализ показал, что последовательность гена отличается от исходной – референтного генома штамма коронавируса, выявленного в Ухане. Сравнительный анализ информации показал, что штаммы коронавируса SARS-CoV-2 с таким типом мутаций чаще встречаются в Европе.
Данные расшифрованных нуклеотидных последовательностей помещены в международную базу данных - Национальный Центр Биотехнологической Информации (NCBI), где в открытом доступе для научного сообщества хранится информация о различных организмах со всего мира. При наличии финансирования в перспективе ученые Центра передовых технологий планируют проанализировать большее количество биологического материала, собранного у инфицированных, чтобы получить статистически значимую информацию по распространенности штаммов коронавируса в Узбекистане, их вирулентности и патогенности.
