Qarorga koʻra, quyidagilar tashkil etiladi:
- yuridik shaxs maqomiga ega boʻlgan Qoraqalpogʻiston ilmiy-amaliy tibbiyot akademiyasi;
- Akademiya tarkibida ilmiy-tadqiqot laboratoriyasi, oʻquv-simulyatsion markaz va mehmonxona.
Nukus shahrida joylashgan davlat va nodavlat davolash-profilaktika muassasalari Akademiyaning klinik bazasi hisoblanadi.
Quyidagilar Akademiya faoliyatining asosiy yoʻnalishlari etib belgilandi, jumladan:
- tibbiyot kadrlarini qayta tayyorlash va malakasini oshirish;
- tashxislash va davolashning yuqori texnologiyali innovatsion usullarini amaliyotga joriy etish;
- telemeditsina texnologiyalaridan keng foydalanish uchun sharoitlar yaratish.
2025/2026 oʻquv yilidan Akademiyada klinik ordinaturada yuqori malakali tibbiyot kadrlarini tayyorlash yoʻlga qoʻyiladi.
2025-yil 1-oktyabrdan Akademiya faoliyati toʻliq yoʻlga qoʻyiladi.