А. Бобоев в 1996 году окончил Ташкентский государственный медицинский институт и продолжил обучение в клинической ординатуре данного вуза.
Трудовую деятельность начал в 1998 году в Ташкентском государственном медицинском институте в должности старшего лаборанта.
В разные годы он работал старшим лаборантом кафедры медицинских биологических наук Ташкентского фармацевтического института, врачом-урологом в многопрофильной центральной поликлинике Алмазарского района Ташкента, консультативно-диагностической поликлинике Республиканской клинической больницы №1, урологическом отделении Республиканской клинической больницы, а также главным специалистом Секретариата Министерства здравоохранения.
За вклад в сферу здравоохранения он был награжден орденом «Саломатлик» II степени. До нового назначения А. Бобоев занимал должность начальника управления здравоохранения Кашкадарьинской области.
